Tollhouse - TU Dresden baut modernen HPC-Komplex

Flottes Beiwerk - PC-Farm für simultane Nutzung

Ergänzend zum HPC-Komplex integriert SGI auch noch eine PC-Farm, die als Plattform für heterogenes Computing dienen soll. Die PC-Farm wird von LinuxNetworx geliefert, zum Einsatz kommen aktuelle AMD-Opteron-Prozessoren. Das ZIH sei so in der Lage, Software für unterschiedliche Prozessortypen (Itanium und Opteron) zu unterstützen.

Auch für die PC-Farm wird ein SAN-Komplex integriert. Laut TU Dresden ebenfalls mit 60 TByte RAID-Storage des Herstellers DDN sowie mit schneller Anbindung sowohl an die Farm wie auch an das HPC-SAN. Als Shared-Filesystem für den PC-Farm-Teil kommt Lustre zum Einsatz. In US-Laboratorien gilt Lustre laut ZIH als Standard für Linux-Cluster.

Die Wissenschaftler erhoffen sich durch den Rechner-Komplex Antworten auf verschiedenste Fragestellungen aus den Bereichen Physik, Materialforschung, Engineering bis hin zu Bioinformatik und Nanotechnologie.

Die TU zählt dazu etwa die Erforschung von organischen Stoffen, die bei chirurgischen Eingriffen an Knochen metallische Legierungen ersetzen können und weniger Unverträglichkeiten hervorrufen. Materialforschung mit Analyse komplexer biomolekularer Reaktionen sind dazu nötig. Ein weiteres Feld könnte die Züchtung neuartiger und perfekter gewachsener Kristalle sein. Die Forscher wollen dabei elektrisch leitfähige Fluide unter Einfluss von Magnetfeldern betrachtet und mit Methoden der Computational Fluid Dynamics (CFD) turbulente Strömungen des Fluids analysieren. Weitere Probleme, die es zu lösen gilt, sind etwa die Beeinflussung von Störgeräuschen im Innenraum eines Autos und das bessere Verständnis der chemischen Reaktionen beim Protein-Docking.

Die Realisierung des Gesamtprojekts ist in zwei Stufen geplant. Die Technologie wird zu einem Drittel, noch diesen Herbst angeliefert. Das ZIH sieht darin eine ´“Preparation“-Umgebung, auf der Benutzer Anwendungscodes und Algorithmen entwickeln und optimieren können. Die Stufe 1 bedeutet die Installation eines SGI-Altix-Bx2-Systems. Lieferstufe 2 soll ab 2006 erfolgen und im Sommer abgeschlossen sein. Die komplette Installation dauert nach Planungen der TU 15 Monate. Das neue System löst bereits während der Stufe 2 den Vorgänger BX2 ab.

Zusätzliche Informationen zum Thema entnehmen Sie den Reports Deutschlands schnellster Supercomputer und Supercomputing. (uba)